Это коррупция( честно-говоря просо забыл нужное слово ) файловой системы. Или во всяком случае очень ее напоминает. Видел подобное на битых флешках/винчестерах, уже и не припомню на чем именно. Кстати характерная черта - файлы огромной длины. А вот вспомнил. Когда флешка от PSP решила умирать, у нее наблюдались похожие симптомы.
Можете ее отформатировать, все отчасти придет в норму, но, думаю, не на долго.